大戦のさなか、本土から疎開する少年少女たちの乗っていた飛行機が攻撃をうけ、孤島に不時着した。
大人たちは全員死亡。 残された少年少女たち30名は、その島でサバイバル生活をすることを余儀なくされた。 当初はリーダーを選び、秩序ある生活を送っていた。 孤島の名は、『蠅島』。原初の生物が棲む。 少年少女たちはしだいに闘争に目覚め、生活は秩序から殺伐へと変化した。 本当の王は誰か?
少年少女たちのバトルロイヤルが始まる。